От исследований in vivo и in vitro к методологии in silico

FROM RESEARCH IN VIVO AND IN VITRO TO METHODOLOGY IN SILICO



Е.Б. Шустов
Ye.B. Shustov
shustov-msk@mail.ru
заместитель директора по научной работе ФГБУН «Научный центр биомедицинских технологий» Федерального медико-биологического агентства, член-корреспондент РАЕН, доктор медицинских наук профессор, лауреат Государственной премии РФ по науке и технике
Deputy Director for Science, Scientific Centre for Biomedical Technologies of Federal Medical-Biological Agency, corresponding member of Russian Academy of Natural Sciences, Doctor of Medicine, professor, recipient of the State Prize of the Russian Federation
г. Санкт-Петербург
St. Petersburg

Ключевые слова:

  • молекулярный дизайн
  • докинг молекул
  • вычислительные эксперименты в фармакологии
  • молекулярная фармакология
  • аденозиновые рецепторы
  • сериновые протеазы
  • Keywords:

  • molecular design
  • docking of molecule
  • computing experiments in pharmacology
  • molecular pharmacology
  • adenosine receptors
  • serine protease
  • Анализируются методологические основы вычислительных экспериментов in silico в современной молекулярной фармакологии. Показано, что исследования вероятного межмолекулярного взаимодействия химических соединений и молекулярных мишеней лекарственных средств позволяют как выявлять новые перспективные лекарства, так и прогнозировать возможную биологическую активность новых соединений.

    We analyze methodological basics of computing experiments in silico in modern molecular pharmacology. We demonstrate that the research of probable intermolecular interaction of chemical compounds and molecular targets of medicines enables us to reveal new promising drugs as well as forecast probable biological activity of new compounds.

    Список использованной литературы

    1. Авенирова Е.Л., Алексеева П.А., Баранова Н.И. [и др.]. Молекулярные аспекты создания лекарственных препаратов: использование методов компьютерного моделирования с целью создания нового противоишемического средства // Биомедицина. 2014. № 1. С. 4–10.
    2. Баранова Н.И., Алексеева П.А., Чистяков К.С. [и др.]. Поиск синтетических антикоагулянтов – ингибиторов сериновых протеаз: сочетание in silico и in vitro методов // Биомедицина. 2014. № 32. С. 17–24.
    3. Баскин И.И., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. Молекулярное моделирование рецепторов физиологически активных веществ для целей медицинской химии // Успехи химии. 2009. Т. 78. №. 6. С. 539–557.
    4. Лагунин А.А., Поройков В.В., Филимонов Д.А., Глориозова Т.А. Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ Pharma Expert № 2006613590 от 16 октября 2006 г. / Федеральная служба по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам. М., 2006.
    5. Филимонов Д.А., Поройков В.В. Прогноз спектров биологической активности органических соединений // Российский химический журнал. 2006. Т. 50. № 2. С. 66–75.
    6. Филимонов Д.А., Поройков В.В., Глориозова Т.А., Лагунин А.А. Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ PASS № 2006613275 от 15 сентября 2006 г. / Федеральная служба по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам. М., 2006.
    7. Drachuk O., Semenov S., Oliynik S. Syntesis, structure analysis and biological activiti spectrum prediction of Antilactate // Biсник проблем бiологii i медицини (Украина). 2011. Вiп. 2. T. 1. С. 120–125.
    8. Lagunin A., Filimonov D.A., Poroikov V.V. Multi-targeted natural products evaluation based on biological activity prediction with PASS // Cur. Phar. Des. 2010. № 16 (15). Р. 1703–1717.

    РФ, Ленинградская область, г. Гатчина, ул. Рощинская, д. 5 к.2